蛋白和代谢类

蛋白和代谢类
蛋白质组学蛋白质组学(Proteomics)一词,源于蛋白质(Protein)与基因组学(Genomics)两个词的组合,意指”一种基因组所表达的全套蛋白质”,即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。蛋白质组本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生、细胞代谢等过程的整体而全面的认识,这个概念最早是由Marc Wilkins在1995年提出的。

基于质谱技术的蛋白质组学研究
生物质谱(Mass Spectrography, MS)技术是蛋白质组学研究中最重要的鉴定技术,其基本原理是样品分子离子化后,根据不同离子之间的质荷比(m/z)差异来分离并确定分子量。目前常用的质谱包括两种:基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)和电喷雾质谱(ESI-MS)。

质谱—— 称量分子质量的精密仪器,主要分为以下四个部分:

质谱鉴定原理:蛋白质经酶切消化成肽段混合物,经离子源电离形成带电离子,质量分析器电场和磁场将具有特定质荷比(m/z)的肽段分离开来,经检测器收集分离的离子,确定每个离子的m/z。经质量分析器分析出每个肽段的m/z,得到蛋白质所有肽段的m/z图谱,即蛋白质的一级质谱峰图。离子选择装置自动选取强度较大的肽段离子进行二级质谱分析,输出选取肽段的二级质谱峰图,通过和理论上蛋白质经蛋白酶消化后产生的一级质谱峰图和二级质谱峰图进行比对而鉴定蛋白质。

蛋白质组学服务内容

蛋白全谱分析

胶条/混合物鉴定

胶点鉴定

蛋白分子量测定

iTRAQ

Label-free

多反应监测(MRM)分析

单个蛋白磷酸化鉴定

磷酸化蛋白全谱鉴定

蛋白质组与转录组关联分析

代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代中期发展起来的一门新兴学科,是系统生物学的重要组成部分,由英国帝国理工大学Jeremy Nicholson教授创立。代谢组学是对某一生物或细胞在一特定生理时期内所有低分子量代谢产物同时进行定性和定量分析。它是以组群指标分析为基础,以高通量检测和数据处理为手段,以信息建模与系统整合为目标的系统生物学的一个分支。可应用于疾病早期诊断、药物靶点发现、疾病机理研究及疾病诊断等。

液相质谱联用(LC-MS)技术结合化学计量学很好地实现了对大量样品和微量代谢物的快速定性、定量分析,极大地推动了代谢组学的相关研究,成为研究代谢组学的主要手段之一。其基本原理是样品分子离子化后,根据不同离子之间的质荷比(m/z)差异来分离并确定分子量,通过与代谢数据库进行比对鉴定代谢物。

液相质谱联用(LC-MS)技术

代谢组学类产品
代谢全谱

目标小分子定量